Gérer une cluster MySQL implique différentes opérations. La première est celle de configurer et de démarrer le cluster MySQL : elle est couverte par les sections Section 16.4, « Configuration de MySQL Cluster » et Section 16.5, « Serveur de gestion du cluster MySQL ». Cette section couvre la gestion d'un cluster MySQL en fonctionnement.

Il y a essentiellement deux moyens pour gérer activement un cluster MySQL en fonctionnement. La première est l'utilisation des commandes dans le client de gestion, qui surveille le statut du cluster, les niveaux de logs, les sauvegardes en cours et les noeuds qui peuvent être arrêtés ou relancés. La seconde méthode utilise le résultat du log du cluster. Le log du cluster est envoyé dans le fichier ndb_2_cluster.log dans le dossier DataDir du serveur de gestion. Le log du cluster contient les rapports d'événements du moteur ndbd et de ses processus dans le cluster. Il est possible aussi d'envoyer le log dans le log système Unix.