Muchos programas MySQL tienen variables internas que pueden ser establecidas en tiempo de ejecución. En MySQL 5.0, las variables de los programas reciben un valor del mismo modo que cualquier otra opción de nombre largo que tome valores. Por ejemplo, mysql tiene una variable max_allowed_packet que controla el máximo tamaño de su buffer de comunicación. Para establecer el valor de la variable max_allowed_packet de mysql en 16MB, use cualquiera de los siguientes comandos:

shell> mysql --max_allowed_packet=16777216
shell> mysql --max_allowed_packet=16M

El primer comando especifica el valor en bytes. El segundo especifica el valor en megabytes. Los valores de las variables pueden tener un sufijo K, M, o G (ya sea en mayúsculas o minúsculas) para indicar la unidad, que puede ser kilobytes, megabytes, o gigabytes.

En un fichero de opciones, la variable se coloca sin precederla con dos guiones:

[mysql]
max_allowed_packet=16777216

O bien:

[mysql]
max_allowed_packet=16M

Si lo prefiere, los caracteres de subrayado en una variable pueden cambiarse por guiones:

Nota: La antigua sintaxis --set-variable = opcion=valor aún se reconoce en MySQL 5.0, pero está obsoleta

Algunas variables del servidor pueden recibir valores en tiempo de ejecución. Para más detalles, consulte Sección 5.3.3.1, “Variables de sistema dinámicas”.