Query Toolbar: A barra de ferramentas de query é onde você criará e executará suas queries. Ela é composta de três botões de navegação (Go Back, Next e Refresh), a área de query, dois botões de ação (Execute e Stop) e um indicador de estado.

Advanced Toolbar: A barra de ferramentas avançada contém três grupos de botões: Os botões de transação (Start, Commit e Rollback), os botões de gerenciamento de query (Explain, Compare) e os botões de construção de query (Select, From, Where e assim por diante.)

A barra de ferramentas avançada só é visível quando as caixas de opção Show advanced toolbars e Show composer buttons toolbar na tela de opções do navegador estão marcadas. veja Section 9.5, “A Seção Browser”.

Result Area: Todos os resultados da query executada são mostrados na área de resultado. Você pode ter múltiplas abas ativas ao mesmo tempo, permitindo que você trabalhe em múltiplas queries. A área de resultado pode ser dividida vertical e horizontalmente para realizar comparações e queries em diferentes partes de uma área de resultado dividida podem ser unidas para análise de resultados resumo/detalhamento (master-detail).

Object Browser: O Navegador de Objetos é parte da barra lateral e permite a você gerenciar seus bancos de dados, marcadores e histórico. Você pode selecionar que banco de dados e tabelas serão pesquisadas, adicionar queries frequentemente usadas a uma coleção de marcadores e navegar através de queries previamente executadas permitindo que sejam usadas novamente.

Caso existam muitos bancos de dados no seu servidor MySQL, o campo de pesquisa com o ícone de lente de aumento é útil para filtrar o banco de dados que você está procurando. Digitar a letra t ou T, por exemplo, irá definir o filtro para bancos de dados cujos nomes comecem com a letra t. O filtro não faz distinção entre letras MAIÚSCULAS ou minúsculas (case-insensitive).

Você também pode filtrar os bancos de dados usando o caracteres curinga ? para substituir uma letra por qualquer caracter e * de nenhuma a qualquer quantidade de caracteres. Por exemplo, a string *boo?* irá procurar por bancos de dados com os nomes books, coursebooks, e bookings.

Information Browser: O Navegador de Informações é parte da barra lateral e é usado para localizar funções embutidas e para gerenciar queries que contenham parâmetros. Um exemplo disto é quando estabelecemos um par de queries resumo/detalhamento (master-detail). Os dados na query master estão disponíveis como parâmetros para a query detail.