Esta seção permite a você definir os valores das varíaveis que o servidor MySQL lê ao inicializar. Estas variáveis são armazenadas no arquivo de opções do servidor. No Windows, o arquivo de opções é chamado my.ini e é localizado no diretório de instalação do Windows (por exemplo, C:\WinNT\my.ini). Perceba que ele pode ser armazenado alternativamente em C:\, e neste caso será nomeado como my.cnf. também perceba que poderá haver mais do que um arquivo de opções. Em sistemas operacionais diferentes do Windows, o arquivo de opção é chamado de my.cnf, independentemente de onde ele seja localizado. No Windows, o MySQL Administrator permite que você armazene o arquivo de opções em qualquer local que você especifique. Veja Arquivo de Opções my.cnf para mais informações.

Perceba que o servidor lê as variáveis armazenadas nos arquivos de opções somente ao iniciar o servidor. Após mudar um arquivo de opções, você deverá reiniciar o servidor para que as alterações tenham efeito. Você pode fazer isso usando os botões Stop Server e Start Server na seção Service Control.